Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CAVIN4Q5BKX8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAVIN4Q5BKX8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms