Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKDCCQ504Y2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms