Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA3BQ502W6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VWA3BQ502W6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3BQ502W6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms