Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BBS9Q3SYG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS9Q3SYG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS9Q3SYG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms