Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms