Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPP1R3AQ16821 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPP1R3AQ16821 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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