Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRY1Q16526 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRY1Q16526 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms