Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDSNQ15517 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDSNQ15517 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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