Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT31Q15323 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT31Q15323 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms