Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD1Q15139 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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