Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIXQ14938 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
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