Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SQLEQ14534 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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