Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM53BQ14153 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM53BQ14153 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms