Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL9A3Q14050 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL9A3Q14050 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL9A3Q14050 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms