Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6HQ13956 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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PDE6HQ13956 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE6HQ13956 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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