Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H3Q13889 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2H3Q13889 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms