Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2BQ13224 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
GRIN2BQ13224 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GRIN2BQ13224 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GRIN2BQ13224 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
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