Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1BQ13112 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms