Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MKRN3Q13064 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN3Q13064 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
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