Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRJQ12913 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRJQ12913 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms