Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNH2Q12809 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms