Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF3C1Q12789 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GTF3C1Q12789 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GTF3C1Q12789 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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GTF3C1Q12789 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF3C1Q12789 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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