Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RPS30AYLR287C-A 192 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 POR1YNL055C 852 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RHO5YNL180C 996 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 PSF3YOL146W 585 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YOR225WYOR225W 330 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YPL185WYPL185W 396 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MAK3YPR051W 531 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 QRI1YDL103C 1434 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 HXT15YDL245C 1704 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 HXT16YJR158W 1704 nt5.45□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 VHT1YGR065C 1782 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 PXL1YKR090W 2121 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RAD3YER171W 2337 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 TWF1YGR080W 999 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YHR213WYHR213W 597 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 HIS6YIL020C 786 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 ATG27YJL178C 816 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MDH1YKL085W 1005 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 AAT2YLR027C 1257 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YAR062WYAR062W 597 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RPS1AYLR441C 768 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MDM38YOL027C 1722 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 XBP1YIL101C 1944 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 CDC1YDR182W 1476 nt5.44□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 UBX3YDL091C 1368 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RTT106YNL206C 1368 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YCR022CYCR022C 345 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 FYV1YDR024W 486 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 VAB2YEL005C 849 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YEL068CYEL068C 333 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 FAU1YER183C 636 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 GVP36YIL041W 981 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 FMP33YJL161W 543 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 NMA1YLR328W 1206 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YLR462WYLR462W 609 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 CPR3YML078W 549 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 SEC17YBL050W 879 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YBL070CYBL070C 321 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 ECM23YPL021W 564 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YPR202WYPR202W 717 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MKK1YOR231W 1527 nt5.43□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 SDA1YGR245C 2304 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RCK2YLR248W 1833 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 NUP1YOR098C 3231 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 EAF6YJR082C 342 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RPC37YKR025W 849 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MRPL44YMR225C 297 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 BUB3YOR026W 1026 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RFC5YBR087W 1065 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 ALD6YPL061W 1503 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 ASM4YDL088C 1587 nt5.42□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 PYC1YGL062W 3537 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 MCM3YEL032W 2916 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 PHO13YDL236W 939 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 HLR1YDR528W 1272 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 CUP2YGL166W 678 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 RTT102YGR275W 474 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 ENV10YLR065C 546 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YOL131WYOL131W 327 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 CSM4YPL200W 471 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YPR114WYPR114W 948 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 GUA1YMR217W 1578 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YDR444WYDR444W 2064 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 EKI1YDR147W 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 SAS10YDL153C 1833 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YDL032WYDL032W 312 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 TMA20YER007C-A 546 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 TIP20YGL145W 2106 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 UTP30YKR060W 825 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YMR130WYMR130W 909 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 TPP1YMR156C 717 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 YNR071CYNR071C 1029 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 STP22YCL008C 1158 nt5.4□□□□□ -1.54
TY1A-NL1Q12391 HSP78YDR258C 2436 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ZRC1YMR243C 1329 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YCL020WYCL020W 1317 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 PRT1YOR361C 2292 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ALT2YDR111C 1524 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YET3YDL072C 612 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 TRM8YDL201W 861 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 IES5YER092W 378 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 FUR1YHR128W 651 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YIL025CYIL025C 375 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 CAP2YIL034C 864 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 AGE2YIL044C 897 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 GCD14YJL125C 1152 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 ASG7YJL170C 630 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YJL193WYJL193W 1209 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YKL083WYKL083W 615 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 YKL177WYKL177W 339 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-NL1Q12391 HRI1YLR301W 735 nt5.39□□□□□ -1.55
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