Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 ALG9YNL219C 1668 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 HAL5YJL165C 2568 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YDR149CYDR149C 708 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 IZH1YDR492W 951 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 LOC1YFR001W 615 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 RPL16AYIL133C 600 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 RPS30AYLR287C-A 192 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 CTK3YML112W 891 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 BRX1YOL077C 876 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YOR366WYOR366W 354 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YPR204WYPR204W 3099 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 PRM2YIL037C 1971 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 ICP55YER078C 1536 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 SLF1YDR515W 1344 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YJL163CYJL163C 1668 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YCL075WYCL075W 441 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 ISC10YER180C 804 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YGL102CYGL102C 429 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YGL199CYGL199C 471 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 SQT1YIR012W 1296 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YJR037WYJR037W 384 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YKL118WYKL118W 312 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YKR032WYKR032W 315 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YNL198CYNL198C 303 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 COQ10YOL008W 624 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 YOL046CYOL046C 675 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 FIT2YOR382W 462 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 SMX3YPR182W 261 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 MSC3YLR219W 2187 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 SIR1YKR101W 1965 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BLQ12266 UBC9YDL064W 474 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YDL177CYDL177C 513 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 PUG1YER185W 912 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YGR025WYGR025W 303 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YPT35YHR105W 645 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 IES3YLR052W 753 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 TOS6YNL300W 309 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 CYC2YOR037W 1101 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 MIC60YKR016W 1623 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 MRE11YMR224C 2079 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 CDC37YDR168W 1521 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 CDC19YAL038W 1503 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 THI20YOL055C 1656 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 FIN1YDR130C 876 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 NUP49YGL172W 1419 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 COX13YGL191W 390 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RME1YGR044C 903 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 TAM41YGR046W 1158 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 AIM24YJR080C 1185 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 ABM1YJR108W 372 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 DPH5YLR172C 903 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GCY1YOR120W 939 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 MCP1YOR228C 909 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GRE1YPL223C 507 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 DSS4YPR017C 432 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GYP1YOR070C 1914 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 ARG81YML099C 2643 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 CHK1YBR274W 1584 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 PER1YCR044C 1074 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YDL183CYDL183C 963 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YDR415CYDR415C 1125 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 BNA7YDR428C 786 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GRX2YDR513W 432 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GRE3YHR104W 984 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YJR111CYJR111C 852 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YSF3YNL138W-A 258 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 RIO2YNL207W 1278 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 STP22YCL008C 1158 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 GUP2YPL189W 1830 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 IML2YJL082W 2196 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 ATE1YGL017W 1512 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 TCM62YBR044C 1719 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 TRM12YML005W 1389 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 AZR1YGR224W 1842 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 DAD1YDR016C 285 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YEL057CYEL057C 702 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 CHZ1YER030W 462 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 QCR6YFR033C 444 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YGR107WYGR107W 450 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 SEN34YAR008W 828 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BLQ12266 YLR290CYLR290C 834 nt5.93□□□□□ -1.46
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