Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSL5	Q12186	GIC1	YHR061C	945 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	RPI1	YIL119C	1224 nt		4.62	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
MSL5	Q12186	BET4	YJL031C	984 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	AUR1	YKL004W	1206 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	PRM9	YAR031W	897 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YLR334C	YLR334C	381 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	AIM36	YMR157C	768 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YOL150C	YOL150C	312 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	FIG1	YBR040W	897 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	RPS9B	YBR189W	588 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	TRS20	YBR254C	528 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	IXR1	YKL032C	1794 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	GYP1	YOR070C	1914 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	GAS5	YOL030W	1455 nt		4.62	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YPS7	YDR349C	1791 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	CTH1	YDR151C	978 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	TAN1	YGL232W	870 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	CCL1	YPR025C	1182 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	GDT1	YBR187W	843 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.61	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	KIN28	YDL108W	921 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	SCM3	YDL139C	672 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YDR053W	YDR053W	396 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	OCA6	YDR067C	675 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	HSP42	YDR171W	1128 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	GLE2	YER107C	1098 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YGL199C	YGL199C	471 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YAL069W	YAL069W	315 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	SFH1	YLR321C	1281 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	HLJ1	YMR161W	675 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	BUD17	YNR027W	954 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YOR238W	YOR238W	912 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	BCS1	YDR375C	1371 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	IME4	YGL192W	1803 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	BAP2	YBR068C	1830 nt		4.6	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	FPK1	YNR047W	2682 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	ACC1	YNR016C	6702 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YCR001W	YCR001W	315 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	MOT2	YER068W	1764 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	YGL204C	YGL204C	306 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	SYS1	YJL004C	612 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	BUD8	YLR353W	1812 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	TRI1	YMR233W	681 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	MPP6	YNR024W	561 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	ATP1	YBL099W	1638 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	MED7	YOL135C	669 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	PNG1	YPL096W	1092 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	SPC29	YPL124W	762 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	PCL8	YPL219W	1479 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	ICS2	YBR157C	768 nt		4.59	□□□□□ -1.67
MSL5	Q12186	TPO2	YGR138C	1845 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YFL034W	YFL034W	3222 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	MTH1	YDR277C	1302 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YDL027C	YDL027C	1263 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	ASP1	YDR321W	1146 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YEL010W	YEL010W	351 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	RSR1	YGR152C	819 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	TDA10	YGR205W	873 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YHL009W-A	YHL009W-A	1242 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	VPS25	YJR102C	609 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	MAP1	YLR244C	1164 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	RPN13	YLR421C	471 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	PET123	YOR158W	957 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	TYE7	YOR344C	876 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	FDH2	YPL275W	711 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	GAL10	YBR019C	2100 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	SPO1	YNL012W	1896 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	ENT2	YLR206W	1842 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	BRF1	YGR246C	1791 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	FOL1	YNL256W	2475 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	KTR6	YPL053C	1341 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	UTP5	YDR398W	1932 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	IDP1	YDL066W	1287 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	MTC7	YEL033W	420 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YGR149W	YGR149W	1299 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	PCT1	YGR202C	1275 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	SGT1	YOR057W	1188 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YFL040W	YFL040W	1623 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	MIG1	YGL035C	1515 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	SMP1	YBR182C	1359 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	GCN5	YGR252W	1320 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YDR203W	YDR203W	318 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	CNL1	YDR357C	369 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	LRS4	YDR439W	1044 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	PUS6	YGR169C	1215 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	TYS1	YGR185C	1185 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YIL082W	YIL082W	873 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	SEN15	YMR059W	387 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MSL5	Q12186	ATP19	YOL077W-A	207 nt		4.56	□□□□□ -1.68

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