Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOBRQ0VD83 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBRQ0VD83 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms