Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC38A11Q08AI6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A11Q08AI6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms