Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 ARO9YHR137W 1542 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 MAD3YJL013C 1548 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 TRX3YCR083W 384 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 ATP5YDR298C 639 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 FOL2YGR267C 732 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 AIM22YJL046W 1230 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 ANB1YJR047C 474 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YAE1YJR067C 426 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 IES3YLR052W 753 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YOR289WYOR289W 756 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 snR37snR37 386 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 GPI13YLL031C 3054 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SLA1YBL007C 3735 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 IOC2YLR095C 2439 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 UBP6YFR010W 1500 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YGL140CYGL140C 3660 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 MRPL7YDR237W 879 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SPI1YER150W 447 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YFR045WYFR045W 930 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YGL132WYGL132W 336 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 COS6YGR295C 1146 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 AAD10YJR155W 867 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SWC7YLR385C 399 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 IBD2YNL164C 1056 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 FDH1YOR388C 1131 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 UGA3YDL170W 1587 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RIF1YBR275C 5751 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SWI1YPL016W 3945 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 TAF1YGR274C 3201 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SRS2YJL092W 3525 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RPN5YDL147W 1338 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 MMR1YLR190W 1476 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RSC3YDR303C 2658 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 CDC9YDL164C 2268 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 GGA1YDR358W 1674 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 ASI1YMR119W 1875 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 THI22YPR121W 1719 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 BSC1YDL037C 987 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 PHO13YDL236W 939 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YDR282CYDR282C 1245 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 VMA22YHR060W 546 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SRP40YKR092C 1221 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 WRS1YOL097C 1299 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RIB4YOL143C 510 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 DER1YBR201W 636 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 MDN1YLR106C 14733 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YPR003CYPR003C 2265 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 MSD1YPL104W 1977 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 UBX5YDR330W 1503 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 BUD27YFL023W 2391 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 BCK2YER167W 2556 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RAD54YGL163C 2697 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RCR2YDR003W 633 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YKE4YIL023C 1041 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YBR137WYBR137W 540 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 FRM2YCL026C-A 582 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 ALR2YFL050C 2577 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 TMN2YDR107C 2019 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 HST1YOL068C 1512 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 LRG1YDL240W 3054 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 OCT1YKL134C 2319 nt2.62□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 BDP1YNL039W 1785 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 CIT1YNR001C 1440 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 STV1YMR054W 2673 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YLR428CYLR428C 345 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 FOL3YMR113W 1284 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 REX4YOL080C 870 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 NAM2YLR382C 2685 nt2.61□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 BUD5YCR038C 1929 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RRN6YBL014C 2685 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 PIR3YKL163W 978 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 MED7YOL135C 669 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YPL073CYPL073C 486 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RRP5YMR229C 5190 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 CLB4YLR210W 1383 nt2.6□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 MNT4YNR059W 1743 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RAD2YGR258C 3096 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RPS13YDR064W 456 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 DIN7YDR263C 1293 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YDR271CYDR271C 372 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 SPO73YER046W 432 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YGL188CYGL188C 174 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 IRC25YLR021W 540 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 YLR122CYLR122C 378 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 RIM11YMR139W 1113 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 TIF34YMR146C 1044 nt2.59□□□□□ -1.99
VAM10Q08474 IDH2YOR136W 1110 nt2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms