Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CXCL9Q07325 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CXCL9Q07325 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CXCL9Q07325 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms