Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 TRM11YOL124C 1302 nt6.14□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 AGE1YDR524C 1449 nt6.14□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 MEC3YLR288C 1425 nt6.14□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 DPH2YKL191W 1605 nt6.14□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 HXT15YDL245C 1704 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 HXT16YJR158W 1704 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 TMA20YER007C-A 546 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 PEA2YER149C 1263 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 ATG27YJL178C 816 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YMR252CYMR252C 405 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 TSR4YOL022C 1227 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 ATX2YOR079C 942 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YSY6YBR162W-A 198 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 TAE1YBR261C 699 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 MET3YJR010W 1536 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 APM2YHL019C 1818 nt6.13□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 RIM1YCR028C-A 408 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 PMT5YDL093W 2232 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 GUK1YDR454C 564 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YER006C-AYER006C-A 318 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YER145C-AYER145C-A 438 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 ILM1YJR118C 612 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 OSW2YLR054C 2175 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 BUR2YLR226W 1188 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YLR400WYLR400W 474 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YNR071CYNR071C 1029 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 HRP1YOL123W 1605 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YBR012CYBR012C 420 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 CMR3YPR013C 954 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 NPL4YBR170C 1743 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 ERV15YBR210W 429 nt6.12□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 UBX3YDL091C 1368 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YML133CYML133C 4125 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 BSC1YDL037C 987 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 FAU1YER183C 636 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YFL051CYFL051C 483 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YMR122CYMR122C 375 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 SCS7YMR272C 1155 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 BUB3YOR026W 1026 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 ARL1YBR164C 552 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 POP1YNL221C 2628 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 RRP9YPR137W 1722 nt6.11□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 TBF1YPL128C 1689 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YHL017WYHL017W 1599 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 ALG2YGL065C 1512 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 NTA1YJR062C 1374 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 ISN1YOR155C 1353 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 PHO13YDL236W 939 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 EAF6YJR082C 342 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 GIM5YML094W 492 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 RNH201YNL072W 924 nt6.1□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 RAP1YNL216W 2484 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YIL055CYIL055C 1884 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YDR199WYDR199W 366 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YVH1YIR026C 1095 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 TDH2YJR009C 999 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 AAT2YLR027C 1257 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YPL077CYPL077C 723 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 POL30YBR088C 777 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 YDR131CYDR131C 1671 nt6.09□□□□□ -1.43
HDA3Q06623 MKS1YNL076W 1755 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 PYC2YBR218C 3543 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 MIG3YER028C 1185 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YGR127WYGR127W 939 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 SPL2YHR136C 447 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YKR011CYKR011C 1062 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YLR463CYLR463C 552 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 DYN3YMR299C 939 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RHO5YNL180C 996 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 LEE1YPL054W 906 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 GLN1YPR035W 1113 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RPB5YBR154C 648 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 EFT2YDR385W 2529 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 EFT1YOR133W 2529 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 ASM4YDL088C 1587 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 HXK2YGL253W 1461 nt6.08□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 NHA1YLR138W 2958 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 GEX2YKR106W 1848 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YDL032WYDL032W 312 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 COX9YDL067C 180 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 snR82snR82 268 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 PPM1YDR435C 987 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YML6YML025C 861 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YML084WYML084W 309 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 PDB1YBR221C 1101 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 RRN7YJL025W 1545 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 PDR18YNR070W 4002 nt6.07□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 ALT2YDR111C 1524 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 PGK1YCR012W 1251 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 DSE2YHR143W 978 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YKL131WYKL131W 522 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 CCP1YKR066C 1086 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 YAR047CYAR047C 321 nt6.06□□□□□ -1.44
HDA3Q06623 DDR48YMR173W 1293 nt6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms