Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7AQ04656 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ATP7AQ04656 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATP7AQ04656 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms