Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNC1Q01954 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms