Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA4P83105 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA4P83105 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms