Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNC1P63316 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNC1P63316 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms