Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERVK_113P63132 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113P63132 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms