Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms