Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LOXL3P58215 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LOXL3P58215 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms