Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL4CP56559 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4CP56559 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms