Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSC2P49815 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSC2P49815 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC2P49815 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC2P49815 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC2P49815 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC2P49815 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC2P49815 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC2P49815 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC2P49815 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC2P49815 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC2P49815 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC2P49815 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC2P49815 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms