Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRIM1P49642 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRIM1P49642 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIM1P49642 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms