Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTBP49356 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTBP49356 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTBP49356 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTBP49356 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTBP49356 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTBP49356 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTBP49356 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms