Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD4P46934 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEDD4P46934 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD4P46934 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms