Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RANGAP1P46060 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RANGAP1P46060 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RANGAP1P46060 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms