Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSKP43235 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSKP43235 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSKP43235 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSKP43235 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSKP43235 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSKP43235 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSKP43235 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSKP43235 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms