Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER3P43115 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGER3P43115 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms