Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX5P35711 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX5P35711 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX5P35711 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOX5P35711 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX5P35711 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX5P35711 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX5P35711 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX5P35711 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX5P35711 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms