Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC2P35250 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC2P35250 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC2P35250 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC2P35250 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC2P35250 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC2P35250 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC2P35250 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC2P35250 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC2P35250 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC2P35250 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC2P35250 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC2P35250 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC2P35250 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC2P35250 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC2P35250 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC2P35250 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC2P35250 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC2P35250 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC2P35250 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC2P35250 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RFC2P35250 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RFC2P35250 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC2P35250 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC2P35250 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC2P35250 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC2P35250 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC2P35250 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC2P35250 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms