Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA7P31268 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA7P31268 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms