Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIPP30301 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MIPP30301 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIPP30301 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MIPP30301 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MIPP30301 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIPP30301 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIPP30301 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIPP30301 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIPP30301 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIPP30301 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIPP30301 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIPP30301 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIPP30301 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIPP30301 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIPP30301 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIPP30301 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms