Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINB3P29508 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINB3P29508 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINB3P29508 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINB3P29508 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINB3P29508 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms